水稻基因組的自然變異是基因改良和現(xiàn)代育種的重要遺傳基礎。因此,要提升水稻育種水平,就必須在大規(guī)模的水稻群體中鑒定出自然變異,并進一步挖掘其中的稀有變異及其潛在應用。研究負責人、中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員商連光表示,科研人員以水稻超級泛基因組為依據(jù),對10548份水稻樣本進行了自然變異分類,構(gòu)建了水稻超大規(guī)模的群體基因組變異數(shù)據(jù)集,這就像一張水稻研究的“數(shù)字地圖”,為育種提供了清晰的指引。
借助“數(shù)字地圖”的幫助,科研人員在水稻育種方面取得了新的突破:一方面糾正了部分水稻秈粳分類上的錯誤;另一方面廣泛分析了重要功能基因在不同亞群中的群體頻率,鑒定了其中的優(yōu)異自然變異。以此為基礎,科研人員還建立了面向全球用戶的在線數(shù)據(jù)庫平臺,為水稻研究提供了單倍型整合分析、變異圖譜分析、系統(tǒng)發(fā)育樹分析等科研服務。
該研究由中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所、崖州灣實驗室、中國水稻研究所、河南大學等單位共同完成。